Über die "Sicherheit", ein Passwort im Klartext gleich neben den SQL Befehl zu schreiben, müssen wir Sie nicht aufklären. Das wird Ihnen selbstverständlich bewußt sein und Sie suchen wahrscheinlich nur eine Lösung um solche Befehle weiterhin nutzen zu können.
Geben Sie das Passwort über die Bash gleich mit an. Hier ein Script-Beispiel:
export MYSQL_PWD=MeinPasswort;mysql -u root -e "CREATE DATABASE example;"